Het begin van de aids-epidemie is een subtiele verschuiving in het genetisch materiaal van een virus waardoor het virus te worden zoönose, wat betekent dat het kan worden overgedragen van dieren op mensen. Over een periode van tijd die waarschijnlijk tientallen jaren duurde, werd het virus herhaaldelijk overgedragen van primaten in Afrika om de mensen, en uiteindelijk werd een steunpunt in de menselijke populatie en begon verspreiden zich buiten de grenzen van het Afrikaanse continent. Tegen de tijd dat wetenschappers en medici in staat waren om alle punten te sluiten, had de aids-epidemie verspreid over een groot deel van de wereld, met ingang van 2007 meer dan 33 miljoen mensen wereldwijd besmet waren met HIV, het virus dat tot aids ontwikkelt.
Er is onenigheid over het begin van de aids-epidemie, en zelfs nu, zijn onderzoekers nog steeds het samenstellen van de stukjes van de puzzel. Het is duidelijk dat het HIV-virus is ontstaan in primaten leven in West-en Centraal-Afrika, en dat het waarschijnlijk is toegezonden aan mensen in gemeenschappen waar mensen eten het vlees van primaten. Sommige onderzoekers hebben gesuggereerd dat de opkomst van steden in Afrika ook kan hebben bijgedragen tot de verspreiding van aids, door zich te concentreren menselijke populaties.
uit Afrika, de AIDS-virus sprong naar Haïti, en toen het begon te snel verspreiden in verschillende richtingen. Een homo stewardess soms als "Patient Zero" genoemd, is vaak belasterd voor het veroorzaken van de aids-epidemie, maar alles wijst erop dat het virus verspreid tegelijkertijd in verschillende gemeenschappen; het HIV-virus daadwerkelijk heeft verschillende groepen of "clades ', ter illustratie van het feit dat het niet werd veroorzaakt door een enkel individu.
De clades suggereren ook iets wat meer interessant, dat is dat HIV en aids zijn waarschijnlijk veel ouder dan mensen denken. De gemeenschappelijke kennis rond de aids-epidemie suggereert dat het virus is ontstaan in de jaren 1980, maar in feite het meer waarschijnlijk begon de verspreiding in de jaren 1930, groeit exponentieel tot er genoeg zaken in de jaren 1980 voor medische professionals om te beseffen dat zij een epidemie. Ten minste een gedocumenteerd aids dood gaat terug tot de jaren 1950, ter ondersteuning van dit standpunt.
Door meer te leren over de verspreiding van de AIDS-epidemie, hopen onderzoekers nieuwe technieken voor de behandeling van ontdekken en misschien eventueel te genezen of vaccineren tegen de ziekte. Bijvoorbeeld, de verschillende subtypen reageren op unieke manieren om de behandeling, illustreren de diversiteit van de HIV en AIDS-virussen, en enkele subtypen zijn meer fatale dan anderen; minder dodelijke clades zijn waarschijnlijk ouder, als hun slachtoffers zou hebben lang genoeg geleefd om de ziekte te verspreiding verder.