Wat is de gen expressie profilering?

Genexpressie is een manier van meten van de mate van activiteit van duizenden genen tegelijk. Het identificeren van genexpressie-patronen in een organisme is de volgende stap na het genoom van een organisme is de juiste volgorde. Gene expression profiling experimenten worden meestal uitgevoerd op het volledige genoom van een organisme in een keer. Meten van genexpressie niveaus in een organisme geeft een beeld van hoe de cellen van het organisme functie tijdens de celcyclus, of in antwoord op specifieke stimuli.

De genen van een organisme kan worden in een van de twee luidt: ingeschakeld of uitgeschakeld. Wanneer een gen wordt ingeschakeld, is het wordt omgezet in boodschapper-RNA, die de instructies geeft voor het maken van het eiwit dat wordt gecodeerd door het gen. Als genen worden ingeschakeld, zij zijn naar verluidt worden uitgedrukt. Wanneer een gen is uitgeschakeld, is het niet wordt omgezet in mRNA en wordt niet uitgedrukt.

Het DNA van zelfs een eencellig organisme bevat duizenden genen, maar slechts een fractie van die genen worden ingeschakeld op elk moment. Het patroon van genexpressie in een cel op een bepaald punt in de tijd wordt aangeduid als de genen profiel. Kijkend naar de soorten van genen ingeschakeld in een cel kan grote hoeveelheden van belangrijke informatie over cellen en organismen.

In een gen expressie profilering experiment, is DNA-microarray technologie gebruikt om een meting van de relatieve activiteit van eerder opeenvolgende genen. Deze experimenten meestal betrekken meten bedragen van mRNA in een controle-instelling en in een experimentele setting, het bepalen van de effecten van een of meer variabelen op gen-expressie. Met behulp van een controle is belangrijk omdat het baseline mRNA niveaus voor normale cellulaire voorwaarden vaststelt.

kijken naar hoe mRNA niveaus veranderen in reactie op prikkels laat zien hoe cellulaire behoeften voor eiwitten veranderen in reactie op nieuwe omstandigheden. Deze informatie is nuttig voor zuiver wetenschappelijke doeleinden, maar kan ook belangrijk zijn in de geneeskunde. Bijvoorbeeld, als borstkanker cellen worden gebruikt in het DNA Microanalysis, kan een profiel laten zien dat in kankercellen borst cellen een bepaald type receptor die normaal actief is inactief is. Als de receptor is aangetoond dat het kanker-specifieke, kan blijken te zijn een effectief geneesmiddel.

Genexpressie heeft, in feite gebruikt als voorspellende maat voor borstkanker. Dit is handig omdat vrouwen in hetzelfde stadium van de ziekte zeer verschillend kan reageren op de behandeling, en hebben zeer verschillende prognoses. Met behulp van DNA Microanalysis opbouwen gen expressie profielen heeft geleerd in ten minste een studie die een bepaalde gen-expressie profiel in borstkankercellen correleert met een slechte prognose. Deze toepassing van gen expressie profilering technologie helpt vrouwen te identificeren die kunnen profiteren van meer agressieve behandeling.