Wat is DNA Sequencing?

DNA-sequencing is een verzameling van wetenschappelijke methoden voor de bepaling van de volgorde van de nucleotiden basen in een molecuul van DNA. Alle levende organismen zijn DNA (desoxyribonucleïnezuur) in elk van hun cellen. Elke cel in een organisme bevat de genetische code voor het hele organisme. Het proces van DNA-sequencing verandert het DNA van een bepaald organisme in een formaat dat gebruikt kan worden door de onderzoekers voor de fundamentele studie van de biologische processen, medisch onderzoek, en in het forensisch onderzoek.

Er zijn verschillende methoden die gebruikt kunnen worden in DNA-sequencing. De eerste methodes werden ontwikkeld in de jaren 1970, en zijn zeer moeizaam en tijdrovend. De meest populaire en gemeenschappelijke sequencing reactie die vandaag gebruikt wordt dideoxynucleotide sequencing, die kan worden gedaan met de hand of door machines, afhankelijk van de hoeveelheid materiaal dat moet worden sequentie.

Het bedrag van genetisch materiaal in een organisme varieert aanzienlijk en wordt gemeten door het aantal nucleotide basen die het bevat. Bijvoorbeeld, een virus of bacterie zo weinig als vijfduizend basen, terwijl het menselijk genoom ongeveer drie miljard basen bevat. De dideoxynucleotide sequencing methode van DNA-sequencing kan vele genoom sequentie in dagen, en grote genoom in jaren, in plaats van tientallen jaren.

Er zijn vier stadia in DNA-sequencing. Eerst wordt het DNA moet worden verwijderd uit de cel. Dan ondergaat een sequencing reactie. Vervolgens wordt het DNA van elkaar gescheiden door grootte, en ten slotte geanalyseerd door een computer die de resultaten plaatst in een bruikbaar formaat.

De eerste stap in DNA-sequencing is om het DNA uit halen van de cel. Dit kan mechanisch of chemisch worden gedaan. DNA komt in twee strengen, maar slechts een onderdeel kan worden gesequenced tegelijk.

Zodra het DNA wordt opgebroken, wordt gelegd op vectoren, die zijn cellen die Will Self-kopie voor onbepaalde tijd, samen met een primer, een chemische stof die het proces wordt gestart. Dit creëert klonen van het DNA van het organisme dat wordt gesequenced. De sequentiebepaling reactie maakt gebruik van de primer te beginnen met het chemische proces van het weergeven van de tweede DNA-streng. De volgorde wordt uitgevoerd in een PCR-apparaat, zodat de reactie wordt vele malen herhaald. Herhaling van de reactie resulteert in een grotere opbrengst van opeenvolgende DNA.

Na sequencing, wordt het DNA op grootte gesorteerd door capillaire elektroforese. Het DNA wordt getrokken door een elektrische stroom door een gel in het capillair, dat is een zeer dunne glazen buis. De DNA-strengen ontstaan gesorteerd op lengte. Als zij uit de capillaire, passeren zij via een laser die kleurstoffen dat identificatie van de nucleotide basen activeert. Deze informatie wordt ingevoerd in een computer, die vervolgens geeft de DNA-volgorde op het scherm.